З крахом стародавнього язичницького світу і приходом християнства почався поступовий захід Афін як центру філософських шкіл і мистецтв. В середині п'ятого століття, коли відбулося остаточне розділення Римської імперії на східну і західну, Афіни відійшли під управління східної її частини (Візантії).
В 6 столітті імператор Юстініан видав закон про остаточне закриття філософських шкіл і перебудови всіх язичницьких храмів в християнських. Після цього Афіни перетворилися на маленьке провінційне містечко обширної імперії і в адміністративному плані були підпорядковані Фівам.
В період з 10 по 12 е сторіччя в Афінах спостерігався деякий розквіт. Константинополь (столиця Візантії) почав висловлювати деякий інтерес до міста головним чином через те, що одна з уродженок міста стала дружиною візантійського імператора. В цей час в місто прибули багато священиків і майстерні майстри, і було побудовано безліч маленьких і прекрасних церков. Але цей плідний період в місті продовжився дуже недовго. Незабаром Афіни знову впали в небуття і убогість.
З майже трьохсот церков візантійського періоду, про які писали мандрівники 17 століть, збереглися дуже небагато.
Однією з найоригінальніших церков візантійської епохи, що збереглися, є так звана Мала Митрополія або церква Святого Елефтерія, що знаходиться в районі Плака. Ета красива церква була побудована в 12 столітті. Вона має хрестоподібну форму і купол, але відрізняється від всіх традиційних церковних споруд своїм матеріалом. Архітектор цієї церкви зібрав уламки пам'ятників всіх історичних періодів і використовував їх в будівництві з унікальною фантазією, отримавши в результаті гармонійну будову, повну краса і витонченість.
На злитті вулиць Ерму і Еолу на Монастіраки знаходиться ще одна візантійська церква 11 століть, присвячена Богородиці, відома як Капникареа. Це хрестоподібний храм з куполом, що спирається на чотири колони. Зовні церква дуже красива і примітна своєю кам'яною кладкою і вставленими в стіни архітектурними фрагментами.
До 11 століття відноситься і церква Святих Теодор, яка знаходиться недалеко від попередньої церкви, на вулиці Еолу. Вона побудована з цегляно-блоковому принципу з каменів і плит. Ще одна церква, яка була побудована по точно такому ж принципу, і відноситься до того ж періоду що і попередня церква, знаходиться на Афінській Агоре, навпроти Гефестеона.
Між вулицями Амаліас і Філеллінон знаходиться церква Святого Никодима. Церква є восьмикутним храмом з великим зведенням, яка була побудована в 11 столітті Стефаном з роду Ліку. В середині 19 століття вона була викуплена російською державою і була передана в дар російській общині в Афінах. Зовнішні стіни храму прикрашає мереживо з цегли і хитромудрий декор у вигляді зірок.
Путівник по Афінах